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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
15/08/2018 |
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Data da última atualização: |
23/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PAIM, T. do P.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTAL, C. M. Mc. |
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Afiliação: |
Tiago do Prado Paim, Instituto Federal Goiano/Campus Iporá; PATRICIA IANELLA, Cenargen; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; Concepta Margaret McManus Pimentel, Universidade de Brasília - Unb/Instituto de Biologia. |
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Título: |
Detection and evaluation of selection signatures in sheep. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos. |
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Conteúdo: |
The recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field. |
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Palavras-Chave: |
Analysis software; SNP markers. |
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Thesagro: |
Genética Molecular; Genoma; Melhoramento Genético Animal; Ovis Aries. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetic resources; Genetic improvement; Genomics; Molecular genetics; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181463/1/Detection-and-evaluation-of-selection.pdf
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Marc: |
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520 $aThe recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 90 | |
| 16. |  | BEDUSCHI, G.; BARROS, G. S. C.; ZEN, S. de; NOGUEIRA NETO, V.; NÉRI, C.; BARROSO, M.; MARTINS, P. do C.; CARVALHO, G. R. SIMLEITE - PREVISÃO DE PREÇOS AO PRODUTOR, n. 23. Brasília, DF: CEPEA / Embrapa Gado de Leite / OCB / CBCL, 30 jan. 2007. 23 5 p.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | BEDUSCHI, G.; BARROS, G. S. C.; ZEN, S. de; NOGUEIRA NETO, V.; NÉRI, C.; BARROSO, M.; MARTINS, P. do C.; CARVALHO, G. R. SIMLEITE - PREVISÃO DE PREÇOS AO PRODUTOR, n. 24. Brasília, DF: CEPEA / Embrapa Gado de Leite / OCB / CBCL, 28 fev. 2007. 24 5 p.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | BEDUSCHI, G.; BARROS, G. S. C.; ZEN, S. de; NOGUEIRA NETO, V.; NÉRI, C.; BARROSO, M.; MARTINS, P. do C.; CARVALHO, G. R. SIMLEITE - PREVISÃO DE PREÇOS AO PRODUTOR, n. 25. Brasília, DF: CEPEA / Embrapa Gado de Leite / OCB / CBCL, 3 abr. 2007. 25 5 p.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 19. | | BEDUSCHI, G.; BARROS, G. S. C.; ZEN, S. de; NOGUEIRA NETO, V.; NÉRI, C.; BARROSO, M.; MARTINS, P. do C.; CARVALHO, G. R. SIMLEITE - PREVISÃO DE PREÇOS AO PRODUTOR, n. 26. Brasília, DF: CEPEA / Embrapa Gado de Leite / OCB / CBCL, 27 abr. 2007. 26 5 p.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 20. | | BEDUSCHI, G.; BARROS, G. S. C.; ZEN, S. de; NOGUEIRA NETO, V.; NÉRI, C.; BARROSO, M.; MARTINS, P. do C.; CARVALHO, G. R. SIMLEITE - PREVISÃO DE PREÇOS AO PRODUTOR, n. 27. Brasília, DF: CEPEA / Embrapa Gado de Leite / OCB / CBCL, 6 jun. 2007. 27 5 p.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 90 | |
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